Collections bactériennes CRB-EML

Le Centre de Ressources Biologiques Environnement Microbiologie Lyon (CRB-EML  NFS96-900) regroupe les collections microbiennes provenant de : 
 

- Travaux de recherche du Laboratoire d'Ecologie Microbienne (UMR5557)

notamment ceux effectués à l'Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine (OTHU) et à la Zone Atelier Bassin du Rhône (ZABR).

- L’Observatoire français des Nocardioses (OFN)

qui assure entre autre une surveillance épidémiologique des nocardioses :  http://ofn.univ-lyon1.fr

-Le Laboratoire National de Référence pour les Escherichia coli producteurs de Shiga Toxines (STEC)

Le LNR est chargé de réaliser des missions réglementaires d’analyses, de surveillance ou d’expertise mais aussi des missions de recherche destinées à améliorer les connaissances actuelles dans le domaine. http://www.vetagro-sup.fr/recherche-expertise/laboratoires-analyse/lmap/

Le CRB-EML :

• Il dispose de technologies innovantes (phénotypage haut débit et génotypage) permettant de garantir l’identité et la traçabilité des ressources via l'adossement à la plateforme PARMIC https://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/structures-d-appui/plateforme-parmic.
• La gestion des stocks de souches est informatisée et accessible entre autres via le BRC-LIMS, Réseau Français des Centres de Ressources Biologiques "micro-organismes" (FBRCMi) : https://brclims.pasteur.fr/brcWeb/souche/recherche).
• La conservation se réalise à différentes températures (-70°C, -150°C, +20°C) dans des pièces à températures contrôlées et surveillées, et sur deux sites indépendants.
   

Expertises :

Collection de souches de sols, de milieux aquatiques, milieux urbains, de l’environnement hospitalier et de cas cliniques

• 260 souches de Nocardia d’origine clinique (OFN) et environnementale
• 33 souches de Gordonia d’origine clinique (OFN) et environnementale
• 51 souches de Burkholderia du complexe cepacia d’origine clinique et environnementale
• 31 souches d’Aeromonas d’origine clinique et hydrique
• 1028 souches de Pseudomonas d’origine clinique et urbaine
• 18 souches d’Agrobacterium et 6 Rhizobium d’origine environnementale
• 50 souches d’E. coli STEC d’origine alimentaire et 77 d’E. coli d’origine clinique
• 6 souches de Stenotrophomonas d’origine environnementale
• 20 souches d’autres genres (Mesorhizobium, Bradyrhizobium, Pantoea, Dickeya, Achromobacter, Chryseobacterium, Hoyosella et Streptomyces)

Accès au catalogue 

Activités :

• Stockage et distribution des souches microbiennes avec l’accord de l’investigateur, en respectant le consentement des donneurs et la règlementation, dans le respect du protocole de Nagoya, https://absch.cbd.int/
• Dépôt et conservation de souches microbiennes d’intérêt patrimonial, publiées, ou sous couvert de projets « Open Science » incluant l’accès au patrimoine biologique
• Caractérisation des ressources biologiques sur le plan phénotypique et génotypique
• Description de nouvelles espèces bactériennes
  
  
   

Pour toute demande de souche, merci de compléter le formulaire ici.
 

Contact :

Adresse générique : crbeml@univ-lyon1.fr
Responsable technique et opérationnel : Emmanuelle BERGERON
Responsables du CRB-EML : Benoit Cournoyer et Veronica Rodriguez Nava