En savoir plus

Interactions bénéfiques plantes-microorganismes : des génomes aux signaux chimique

(G. Comte, D. Muller, C. Prigent-Combaret, F. Wisniewski-Dyé)

Mécanismes impliqués dans les effets phytobénéfiques (phytohormones, composés antimicrobiens, fixation N, solubilisation P, induction de défenses…)

Médiateurs chimiques de ces interactions (analyses UPLC-QTOF et CPG-QQQ, plateforme CESN) (thèses A. Lautrey, A. Ballot; post-doctorat T. Lurthy)

Voies de biosynthèse microbiennes et leur régulation (séquençage et annotation de nouveaux génomes de microorganismes phytobénéfiques, thèse A. Ballot)

Réponses physiologiques chez la plante hôte (RNAseq) (thèses A. Lautrey, A. Ballot)

Mécanismes de coévolution entre les plantes et les microorganismes phytobénéfiques (Evolution expérimentale sur communautés microbiennes in planta).

Rôle écologique du microbiote racinaire

(J. Almario, Y. Moënne-Loccoz, D. Muller, C. Prigent-Combaret)

• Etude / suivi de groupes fonctionnels phytobénéfiques (fixateurs d'azote, producteurs de phytohormones…) et leur impact sur la croissance végétale (qPCR, metabarcoding, métagénomique)
• Coévolution plante-microbiote impact du génotype de la plante et des processus de domestication/sélection sur le fonctionnement du microbiote racinaire (identification de QTL impliqués dans les interactions phytobénéfiques en collaboration avec le GDEC; thèse C. Gruet)
• Microbiote racinaire et nutrition phosphorée de la plante, focus sur les plantes non-mycorhiziennes (projet CNRS E2CO MicroPhos; J. Almario, Y. Moënne-Loccoz)
• Microbiote racinaire et résistance de la plante à la maladie, cas des sols résistants aux maladies (qPCR, metabarcoding, métagénomique) (Analyse de réseaux microbiens contribuant à la protection des plantes; thèse I. Todorovic, projet EU Biodiversa SuppressSOIL, https://www.biodiversa.org/1778/download)

Transfert de connaissances : du laboratoire au champ

(G. Comte, Y. Moënne-Loccoz, D. Muller, C. Prigent-Combaret, F. Wisniewski-Dyé)

Identification de nouveaux mécanismes et agents de phytoprotection et leur application contre la fusariose et la septoriose du blé (projet Région DOPELARA; thèse A. Ballot; collab. GDEC et GreenCell)

Développement d'agents de phytoprotection contre les plantes parasites (ANR Ecophyto Weeds Biocontrol ; https://anr.fr/Project-ANR-19-ECOM-0002)

Exploiter la fixation d'azote par les endophytes pour une production des céréales durable (ANR– FIXN-MAIZE; collab. Roullier; https://anr.fr/Projet-ANR-16-CE04-0007)