Les activités de recherche du LEM sont adossées à plusieurs collections de microorganismes issues de nos travaux et de nos activités d’expertise :

- Le Centre de Ressources Biologiques Environnement Microbiologie Lyon (CRB-EML  NFS96-900)

Ce CRB fait partie intégrante du Réseau Français des Centres de Ressources Biologiques "micro-organismes" (FBRCMi) : https://brclims.pasteur.fr/brcWeb/souche/recherche. En sélectionnant la collection « EML » dans le catalogue de ce site, vous avez accès et pouvez commander les nombreux isolats (principalement des genres Aeromonas, Gordonia, Nocardia et des espèces Burkholderia cenocepacia, Escherichia coli, et Pseudomonas aeruginosa).

• Le CRB est adossé au plateau technique PARMIC et assure l'ensemble des missions suivantes :
• Pérennité de collections de microorganismes -> Cryo-conservation à -80°C (3 lots) sur deux sites de stockage Lyon I
• Facilité d’accès aux souches selon les autorisations de distribution accordées par les propriétaires -> collecte et distribution
• Gestion des informations concernant ce patrimoine (système BRC LIMS)
• Protection des droits des découvreurs/inventeurs/propriétaires (dans le respect du protocole de Nagoya).

Si vous êtes agent du LEM et souhaitez déposer une souche dans la collection CRB-EML :

• Vérifier si votre ressource est soumise à la réglementation Nagoya (https://absch.cbd.int/)
• Compléter la fiche de renseignement (disponible ici) et l'envoyer à  emmanuelle.bergeron@univ-lyon1.fr et à crbeml@univ-lyon1.fr

- L’Observatoire français des Nocardioses (OFN)

qui assure entre autre une surveillance épidémiologique des nocardioses :  http://ofn.univ-lyon1.fr

-Le Laboratoire National de Référence pour les Escherichia coli

y compris les Escherichia coli producteurs de Shiga like-toxins (STEC) qui peuvent être rencontrés dans les aliments. Le LNR est chargé de réaliser des missions réglementaires d’analyses, de surveillance ou d’expertise mais aussi des missions de recherche destinées à améliorer les connaissances actuelles dans le domaine. http://www.vetagro-sup.fr/recherche-expertise/laboratoires-analyse/lmap/