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Accueil > Présentation > Thèmes transversaux > Gènes et médiateurs des interactions biologiques

Gènes et médiateurs des interactions biologiques

Etude des interactions biotiques dans le continuum parasitisme-mutualisme entre microorganismes et entre microorganismes et hôtes eucaryotes. Cela concerne la génétique, les mécanismes moléculaires, les métabolites (des substrats aux signaux) médiateurs de ces interactions.

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Approches globales :

  • Développement d’approches « omics » pour identifier des gènes/médiateurs de l’interaction 
  • Identification des coûts et bénéfices pour les partenaires de l’interaction 
  • Compréhension du contrôle, de la maîtrise du partenaire
  • Etude d’une interaction à deux au concept d’holobionte : d’un système simplifié à un système complexe d’interactions 
  • Dynamique spatio-temporelle des interactions
  • Identification des réseaux métaboliques au sein de l’interaction

Approches ciblées :

  • Imagerie et marquage isotopique pour tracer une bactérie ou un métabolite 
  • Impact de la génétique de l’hôte sur l’interaction 
  • Analyse fonctionnelle des déterminants génétiques impliqués dans l’interaction hôte-microorganisme 
  • Régulation de l’interaction de l’échelle cellulaire à l’environnement (régulateurs à 2 composants, Riboswitch, ARNnc, ARNi…)
  • Applications des interactions hôte-microorganisme : santé, agronomie, etc...

Mots-clés : interaction, symbiose, parasitisme, commensalisme, gènes, médiateurs, holobionte, microbiote, communauté microbienne, réseaux métaboliques, fonction, régulation

Plateformes :
PGE, AME, CESN et PARMIC de l’UMR5557 : http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique72
SERRE, DTAMB, Eco-Ressources, SYMBIOTRON, PRABI… de la Fédérations Bio-Environnement Santé : http://bioenvis.universite-lyon.fr/-La-Federation-.html

Contacts : Hasna Boubakri & Florence Wisniewski-Dyé

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