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Gènes et médiateurs des interactions biologiques
Etude des interactions biotiques dans le continuum parasitisme-mutualisme entre microorganismes et entre microorganismes et hôtes eucaryotes. Cela concerne la génétique, les mécanismes moléculaires, les métabolites (des substrats aux signaux) médiateurs de ces interactions.
Approches globales :
- Développement d’approches « omics » pour identifier des gènes/médiateurs de l’interaction
- Identification des coûts et bénéfices pour les partenaires de l’interaction
- Compréhension du contrôle, de la maîtrise du partenaire
- Etude d’une interaction à deux au concept d’holobionte : d’un système simplifié à un système complexe d’interactions
- Dynamique spatio-temporelle des interactions
- Identification des réseaux métaboliques au sein de l’interaction
Approches ciblées :
- Imagerie et marquage isotopique pour tracer une bactérie ou un métabolite
- Impact de la génétique de l’hôte sur l’interaction
- Analyse fonctionnelle des déterminants génétiques impliqués dans l’interaction hôte-microorganisme
- Régulation de l’interaction de l’échelle cellulaire à l’environnement (régulateurs à 2 composants, Riboswitch, ARNnc, ARNi…)
- Applications des interactions hôte-microorganisme : santé, agronomie, etc...
Mots-clés : interaction, symbiose, parasitisme, commensalisme, gènes, médiateurs, holobionte, microbiote, communauté microbienne, réseaux métaboliques, fonction, régulation
Plateformes :
PGE, AME, CESN et PARMIC de l’UMR5557 : http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique72
SERRE, DTAMB, Eco-Ressources, SYMBIOTRON, PRABI… de la Fédérations Bio-Environnement Santé : http://bioenvis.universite-lyon.fr/-La-Federation-.html
Contacts : Hasna Boubakri & Florence Wisniewski-Dyé
