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Plateforme d’Analyses des Ressources MICrobiologiques (PARMIC)

Le PARMIC est située au 4e étage du bâtiment Forel (Doua), à disposition des équipes de notre unité et ouvert aux structures d’enseignement et de recherche. La plateforme est composée d’un laboratoire de microbiologie classé niveau 2. Les Clusters Environnement et Plantes de la Région Rhône-Alpes et le département Environnement et Développement Durable du CNRS, nous ont permis d’acquérir :

  • Vitek2 Compact, BioMérieux : capacité 30 cartes

Identification basée sur la mesure de l’utilisation des sources de carbone et l’activité enzymatique des souches.
Antibiogramme avec détermination des CMI et les résultats des tests de résistance pour chaque antibiotique.

  • OmniLog Combo, Biolog : capacité 50 microplaques identification et phénotypage peuvent être réalisés simultanément

Identification avec la microplaque GENIII, sans Gram préalable, avec une base de données de 1900 souches et la possibilité de créer votre propre base de données.
Phénotypage avec les différentes microplaques PM par l’étude de plusieurs voies métaboliques.
La microplaque Empty permet de confectionner une microplaque sur mesure au laboratoire.

  • Bioscreen
    Appareil suivi de la croissance par mesure de la turbidité à différentes longueurs d’ondes
    Suivi de 200 échantillons simultanément, 8 filtres de 405nm à 600nm
    Choix de la température d’incubation avec système de contrôle de la température
    Choix de la vitesse et de l’amplitude d’agitation et la durée de l’agitation, résultats sous format excel.
  • Spectrophotomètre GeneQuant 1300
  • Microscope trinoculaire, Minolta
  • Système eau MilliQ
  • PH mètre portatif
  • PSM : poste de sécurité microbiologique,
  • Hotte à flux laminaire
  • Autoclave Laboster, Subtil-Crépieux
  • 2 Etuves Binder dont une réfrigérée
  • Centrifugeuse Eppendorf pour microtubes à l’intérieur du laboratoire L2
  • Centrifugeuse Eppendorf pour microtubes, tubes à hémolyse ou Falcon ou microplaques.
  • Incubateur Innova 4360, New Brunswick , avec agitation éclairage et programmable
  • CHEF-DR III, Biorad  : Système de champs pulsé pour réaliser les profils génétiques.
  • Bain-marie et tout petit matériel et consommable sont disponible sur la plateforme pour la préparation des microplaques (pipettes distributrices, micropipettes, réservoirs pour multicanaux, pointes stériles, eau stérile…)

Le planning de réservation « PARMIC » sur l’intranet de l’unité GRR vous permet d’effectuer les réservations et consulter les documents et protocoles disponibles sur les appareils. http://ecomicro.univ-lyon1.fr/grr

Sur les tarifs prestataires sur l’intranet de l’unité, vous trouverez les devis négociés de la société AWEL pour les consommables Biolog, société Biomérieux pour le Vitek et de la société Thermo-Fische pour les plaques Bioscreen.
Pour toute information complémentaire
Laurence LOISEAU (04.72.43.27.84) laurence.loiseau univ-lyon1.fr

Centre de Ressources Biologiques Environnement Microbiologie Lyon

mail : crbeml univ-lyon1.fr

Site web :http://www.crb-eml.org/

Le CRB-EML assure la sauvegarde de collections de micro-organismes principalement issues de travaux d’équipes de recherche de l’Unité d’Ecologie Microbienne de Lyon.

Le CRB-EML participe au projet Biobanques et fait partie du Réseau Français des Centres de Ressources Biologiques "micro-organismes" (FBRCMi) (http://www.fbrcmi.fr/). Il est engagé dans une démarche Qualité visant à obtenir une certification selon la norme NF S96-900.

Services proposés :
Conservation de souches microbiennes publiées
Distribution de souches : les souches de la collection peuvent être achetées et utilisées par les laboratoires français de recherche publique.