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Accueil > Equipes de Recherche > Multi-résistance Environnementale et Efflux Bactérien > Multi-résistance Environnementale et Efflux Bactérien

Multi-résistance Environnementale et Efflux Bactérien

Responsable : NAZARET Sylvie
Co-Responsable : DIJOUX-FRANCA Marie-Geneviève

Personnels permanents

BROTHIER Elisabeth Ingénieur d’etude, CNRS
DIJOUX-FRANCA Marie-Geneviève Professeur, UCB
FAVRE-BONTE Sabine Maitre de Conférences, UCB
MEIFFREN Guillaume Ingénieur d’etude, UCB
MICHALET Serge Maître de Conférences, UCB
NAZARET Sylvie Chargé de Recherche, CNRS
BODILIS Josselin Maître de Conférences, UCB(visite)

Personnels non permanents

Pham Nam Hoang Thèse USTH
Samira Ait Moussa Thèse 12-15
Moussa Aoudalkarim Thèse 12-15
Salomon Bouba Thèse 13-16
Elodie Denet Thèse 14-17




Présentation :




Les pressions de sélection occasionnées par des stress chimiques tels que les antimicrobiens peuvent entrainer chez les bactéries le développement d’un phénotype de « multidrug résistance » (MDR). Ce phénotype est commun dans le contexte hospitalier où l’usage intensif d’antibiotiques et d’antiseptiques favorise l’émergence et la dispersion de la résistance chez les agents infectieux. Outre les bactéries pathogènes ce phénotype MDR est présent chez des espèces indigènes d’écosystèmes naturels soumis à de fortes contraintes anthropiques contaminés par des antibiotiques, des métaux lourds, ou des hydrocarbures.



A la kyrielle de mécanismes spécifiques e.g. inactivation de la molécule, modification de la cible,… contribuant à la résistance aux antimicrobiens se rajoute un mécanisme plus généraliste faisant intervenir les pompes à efflux. Sous-estimée pendant longtemps, l’implication de ces pompes dans l’émergence de souches bactériennes multi-résistantes et l’apparition de résistance de haut niveau est aujourd’hui acquise.



Ces pompes ubiquistes chez les procaryotes peuvent représenter au moins 10% des transporteurs d’une espèce, et se répartissent en plusieurs familles dont certaines présentent un large spectre de substrats. La présence abondante de bactéries de phénotype MDR associé aux pompes dans des milieux tel que le sol ou la rhizosphère des plantes suggère que ces pompes ne sont pas seulement impliquées dans la résistance aux antibiotiques. Leur implication dans la détoxication intra-cellulaire, la virulence, l’homéostasie ou la communication inter-cellulaire figurent parmi les principales fonctions proposées.



Les activités de recherches de l’équipe visent à comprendre le rôle des pompes à efflux d’espèces telluriques dans leur habitat naturel, leur implication dans l’adaptation aux stress (métabolites secondaires des plantes, ou de la faune, métaux, température,…), et l’émergence des phénotypes MDR. Elles visent par ailleurs à évaluer l’avantage sélectif conféré par l’association phénotype MDR/pompes à efflux dans la colonisation de nouvelles niches.




Nos travaux s’intègrent dans deux thèmes :

Thème 1
Thème 2
Réservoir des métabolites induisant le phénotype MDR et des gènes de pompes à efflux
<=>
Rôle et dynamique du phénotype MDR, des gènes de pompes à efflux et des métabolites induisant le phénotype MDR

Bibliographie  :

2017



  • Crampon M, et al. 2017. Low effect of phenanthrene bioaccessibility on its biodegradation in diffusely contaminated soil. Environmental Pollution. 225:663-673. doi: 10.1016/j.envpol.2017.03.053.


  • Michalet S, et al. 2017. Tolerance of Japanese knotweed s.l. to soil artificial polymetallic pollution: early metabolic responses and performance during vegetative multiplication. Environmental Science and Pollution Research. 1-11. doi: 10.1007/s11356-017-9716-8.


  • Pham HN, et al. 2017. Impact of metal stress on the production of secondary metabolites in Pteris vittata L. and associated rhizosphere bacterial communities. Environmental Science and Pollution Research. 1-16. doi: 10.1007/s11356-017-9167-2.

2016



  • Bodilis J, et al. 2016. Draft Genome Sequences of Stenotrophomonas maltophilia Strains Sm32COP, Sm41DVV, Sm46PAILV, SmF3, SmF22, SmSOFb1, and SmCVFa1, Isolated from Different Manures in France. Genome Announcements. 4:e00841-16. doi: 10.1128/genomeA.00841-16.


  • Cavé L, et al. 2016. Efficiency and sensitivity of the digital droplet PCR for the quantification of antibiotic resistance genes in soils and organic residues. Applied Microbiology and Biotechnology. 1-12. doi: 10.1007/s00253-016-7950-5.


  • Deredjian A, et al. 2016. Occurrence of Stenotrophomonas maltophilia in agricultural soils and antibiotic resistance properties. Research in Microbiology. doi: 10.1016/j.resmic.2016.01.001.


  • Lebot V, Michalet S, Legendre L. 2016. Identification and quantification of phenolic compounds responsible for the antioxidant activity of sweet potatoes with different flesh colours using high performance thin layer chromatography (HPTLC). Journal of Food Composition and Analysis. 49:94-101. doi: 10.1016/j.jfca.2016.04.009.

  • Randriamboavonjy JI, et al. 2016. Cardiac Protective Effects of Moringa oleifera Seeds in Spontaneous Hypertensive Rats. American Journal of Hypertension. 29:873-881. doi: 10.1093/ajh/hpw001.


  • Youenou B, et al. 2016. Impact of untreated urban waste on the prevalence and antibiotic resistance profiles of human opportunistic pathogens in agricultural soils from Burkina Faso. Environmental Science and Pollution Research. 1-13. doi: 10.1007/s11356-016-7699-5.

2015



  • Chaabane F, et al. 2015. In vitro and in vivo anti-melanoma effects of Daphne gnidium aqueous extract via activation of the immune system. Tumor Biology. doi: 10.1007/s13277-015-4492-x.

  • Chahad AM, et al. 2015. Medicinal Plants from the Ouaddaï Province (Chad): An Ethnobotanical Survey of Plants Used in Traditional Medicine. Journal of Alternative and Complementary Medicine (New York, N.Y.). 21:569-577. doi: 10.1089/acm.2014.0243.


  • Christina M, et al. 2015. Allelopathic effect of a native species on a major plant invader in Europe. The Science of Nature. 102:1-8. doi: 10.1007/s00114-015-1263-x.


  • Lebot V, Lawac F, Michalet S, Legendre L. 2015. Characterization of taro [Colocasia esculenta (L.) Schott] germplasm for improved flavonoid composition and content. Plant Genetic Resources. 1-9. doi: 10.1017/S1479262115000581.


  • Yan X, et al. 2015. Brilliant glyconanocapsules for trapping of bacteria. Chem. Commun. 51:13193-13196. doi: 10.1039/C5CC04653J.


  • Youenou B, et al. 2015. Comparative genomics of environmental and clinical <i>Stenotrophomonas maltophilia</i> strains with different antibiotic resistance profiles. Genome Biology and Evolution. evv161. doi: 10.1093/gbe/evv161.

2014



  • Azzouzi S, et al. 2014. Phytochemical and biological activities of <i>Bituminaria bituminosa L.</i> (Fabaceae). Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 7:S481-S484. doi: 10.1016/S1995-7645(14)60278-9.

  • Chaabane F, et al. 2014. In vitro antileukaemic activity of extracts from Daphne gnidium leaves against sensitive and multidrug resistant K562/R7 cells. Tumour Biology: The Journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine. 35:8991-8998. doi: 10.1007/s13277-014-2129-0.

  • Kilani-Jaziri S, et al. 2014. Evaluation of in vitro antioxidant and apoptotic activities of Cyperus rotundus. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 7:105-112. doi: 10.1016/S1995-7645(14)60004-3.


  • Toussirot M, et al. 2014. Dyeing properties, coloring compounds and antioxidant activity of Hubera nitidissima (Dunal) Chaowasku (Annonaceae). Dyes and Pigments. 278-284. doi: 10.1016/j.dyepig.2013.11.010.

  • Youenou B. 2014. Les sols anthropisés, incubateurs d'agents bactériens pathogènes de l'homme : typage génétique, métabolique et antibio-résistance d'agents opportunistes. http://n2t.net/ark:/47881/m6862drv (Consulté sans date).

2013



  • Colinon C, et al. 2013. Detection and enumeration of Pseudomonas aeruginosa in soil and manure assessed by an ecfX qPCR assay. Journal of Applied Microbiology. doi: 10.1111/jam.12189.


  • Michalet S, et al. 2013. Phytochemical analysis of mature tree root exudates <i>in situ</i> and their role in shaping soil microbial communities in relation to tree N-acquisition strategy. Plant Physiology and Biochemistry. 72:169-177. doi: 10.1016/j.plaphy.2013.05.003.


  • Rakotomalala G, et al. 2013. Extract from Mimosa pigra attenuates chronic experimental pulmonary hypertension. Journal of Ethnopharmacology. 148:106-116. doi: 10.1016/j.jep.2013.03.075.


  • Youenou B, Brothier E, Nazaret S. 2013. Diversity among strains of Pseudomonas aeruginosa from manure and soil, evaluated by multiple locus variable number tandem repeat analysis and antibiotic resistance profiles. Research in Microbiology. doi: 10.1016/j.resmic.2013.10.004.