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Accueil > Actualités > Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique

Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique

Les 25 et 26 janvier 2010 se tiendront à Montpellier les journées "Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique", organisées conjointement par l’axe "analyse de séquences" du GDR Bio-Informatique Moléculaire (3003) et le groupe de travail COMATEGE du GDR Informatique Mathématique. L’adresse internet : http://www.lirmm.fr/mab/gtseq
Les thèmes abordés vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte et leurs applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité :

  • algorithmes du texte
  • structures d’indexation
  • combinatoire des mots
  • recherche, découverte et analyse de motifs
  • statistique des mots
  • analyse de séquences
  • cartographie et annotation des génomes
  • haplotypes et polymorphismes
  • approches ab initio et approches comparatives
  • méthodes de génomique comparative
  • outils d’analyse des répétitions génomiques
  • analyse des données de séquençage haut-débit (SHD, NGS)